Le Lagon Bleu de Comino occupe un bassin calcaire peu profond entre deux caps sur la côte ouest de l'île, son fond sablonneux étant visible à travers une eau qui réfracte la lumière en bandes cyan et cobalt.
Le lagon mesure environ 300 mètres de large, abrité par des falaises qui s'élèvent à 40 mètres sur trois côtés et alimenté par les courants méditerranéens qui nettoient le bassin deux fois par jour. Aucune route ne mène à Comino — l'île de 3,5 kilomètres carrés est inhabitée à l'exception d'un seul hôtel — donc chaque visiteur arrive par bateau depuis Malte ou Gozo, une traversée qui prend de 20 à 30 minutes selon le point de départ.
La clarté du lagon provient de sa géologie. Le calcaire à Globigérines, la même roche sédimentaire qui forme les plateformes côtières de Malte, se dissout lentement dans l'eau de mer et laisse un minimum de sédiments en suspension. Des prairies de Posidonies ancrent le fond sableux et filtrent les nutriments, maintenant une visibilité qui dépasse régulièrement les 30 mètres. La température de l'eau varie de 15 °C en février à 26 °C en août, assez chaude pour une baignade prolongée six mois par an. Les plongeurs privilégient le bord nord du lagon, où le plateau descend à 12 mètres et révèle des grottes submergées creusées pendant la dernière période glaciaire, lorsque le niveau de la mer était 120 mètres plus bas.
Les billets pour le Lagon Bleu de Malte regroupent généralement le transport en bateau avec des arrêts optionnels au Crystal Lagoon — une crique plus étroite à 400 mètres au sud — et des grottes marines le long de la côte nord de Comino, où l'érosion a creusé des arches et des tunnels dans la paroi de la falaise. La plupart des opérateurs partent entre 08h00 et 10h00 pour s'assurer un amarrage avant la saturation de midi, lorsque jusqu'à 40 navires mouillent simultanément. Le système de réservation officiel introduit en 2024 limite le nombre de visiteurs quotidiens mais ne facture pas de frais d'entrée ; l'inscription suit simplement la capacité et alloue des créneaux horaires pendant les semaines de pointe de juillet et août. Les itinéraires incluant Gozo ajoutent une deuxième île, traversant le canal de Comino sur 5 kilomètres pour visiter la Citadelle à Victoria ou la mer intérieure à Dwejra, un dôme calcaire effondré désormais ouvert sur la Méditerranée. Ces circuits d'une journée complète durent généralement de sept à huit heures, avec deux à trois heures réservées au lagon lui-même. Les excursions en bateau fonctionnent toute l'année, bien que les horaires d'hiver réduisent la fréquence et certains opérateurs suspendent le service entre décembre et février lorsque la houle dépasse un mètre.
7 h
